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本頁列出了當前已知的實際版本問題，以及自第一個版本(5.00)以來修復的問題。請注意，此處報告的問題包括錯誤(對應于不正確的軟件功能)和功能(可能以更有用或更容易使用的方式實現的軟件功能)。
如何更新到最新的Canoco版本
要將您當前的Canoco 5安裝更新到最新的維護版本，請選擇 Help|Check for updates 菜單命令，并按照對話框中顯示的說明進行操作。請注意，Canoco經銷商提供的用于評估軟件的試用版無法更新。
5.15版中修復的問題和增加的改進
- 改進[515-01]:增加了執行蒙特卡羅置換檢驗（permutation test）的新方法。除了之前置換響應數據的方法(也稱為Y置換)，用戶現在可以選擇置換預測值(X置換)。此外，當使用包含協變量的模型進行測試時，Y排列的算法通過向協變量添加截距得到了適度的改進。仍然存在執行舊類型(“遺留”)Y置換的選項。描述Y-和X-置換的論文在Canoco安裝文件夾的pdf子文件夾中，名為“CCA_permutations_draft.pdf”(最相關)和“RDA_permutations.pdf”(更理論化)。
- 改進[515-02]:在雙約束排序分析中增加了新的統計摘要。大多數(10)的統計數據是按單個雙約束排序軸提供的，但也提供了兩個解釋變異的調整估計。所有這些新的統計數據都顯示在專門的分析筆記本頁面(稱為雙重約束[P]CA ),其中放置了雙重置換檢驗(基于個案和基于響應變量)和可選維度檢驗的摘要。新的復制按鈕允許將大多數顯示的信息(舊的和新的)復制到剪貼板上。專業分析筆記本頁面也變得可以滾動。
- 改進[515-03]:在雙約束排序分析中增加了新型回歸雙標圖，代表CWM(社區加權平均值)對環境預測因子的回歸。
- 修復錯誤[515-04]:在設置雙約束排序分析期間，不允許在分析步驟中更改行權重，權重是從前面的步驟轉移到這些步驟的。這確保了實施dc-CA或dc-PCA方法的各個步驟的一致性。
- 改進[515-05]:增加了冪變換(指數的默認值為0.1，允許范圍為0.01到4)，它既可以應用于成分數據表(通常具有社區成分)，也可以應用于一般數據表中的單個數值變量。
- 功能[515-06]:不再支持在蒙特卡羅置換檢驗期間對殘差進行杠桿校正。
- 修復bug [515-07]:使dc-(P)CA算法在Canoco 5項目中選擇響應變量貢獻比例時不會產生錯誤的結果。這在適當的步驟中現在被忽略。
- 改進[515-08]:交互式逐步選擇對話框現在在已選擇的預測項列表中顯示了每個預測項在模型選擇階段被選擇時的偽F統計。
- 修正錯誤[515-09]:用直方圖圖形化總結蒙特卡洛置換檢驗結果的窗口在調整大小時不能正確重繪。
- 改進[515-10]:在有限數量的情況下，沒有計算所有約束軸。例如，當您的約束(解釋)變量形成一個具有9個自由度的模型，并且您的數據集有11個案例時，應該可以計算所有9個受約束的軸(盡管數據集不太適合詢問如此復雜的模型)，但Canoco僅估計了前四個。
- 改進[515-11]:擴展了Graph Wizard為雙約束排序分析(dc-CA和dc-PCA，包括所有分析模板變量)結果提供的排序圖列表，特別添加了CWM分析的回歸雙標圖，該雙標圖總結了雙約束排序中使用的環境預測因子上個體功能性狀的社區加權平均值(CWM)的(多重)回歸。這些圖的描述-由Graph菜單中的“Describe contents”命令提供-也得到了改進。
- 修復bug [515-12]:當修改現有分析(該分析根據稀有物種的出現頻率指定排除稀有物種)時，包含個案集的變化不會立即反映在排除物種集中，因此必須完成分析定義，并重新打開和修改設置，以獲得正確的結果。
- 修復錯誤[515-13]:當使用項目|創建派生項目|展開事件創建展開的項目(即“每個案例一個響應變量”)時...菜單命令，完全空的情況下不展開，這在使用線性排序方法分析此類數據時效果不佳。
- 修正錯誤[515-14]:當創建一個擴展的項目時，最初的空行被賦予權重1.0e-16，而不是精確的零。
- 改進[515-15]:在等值線圖中標注等值線時，指定固定小數位數作為首選格式，小數部分的尾隨零位數不應刪除。
- 改進[515-16]:在等值線圖中標注等值線時，避免生成帶有負號的零值標注(即“-0.0”之類的標注)。
- 改進[515-17]:當只有一個受約束的軸時，t值雙標圖的軸的建議固定范圍(-1到+1)大部分錯過了要在圖形中顯示的范多本圓的所需范圍。因此，在這種情況下，對話框提供并使用(當用戶保持選中該框時)范圍-1.1到+1.1。
- 改進[515-18]:介紹性文本字段的結尾描述了以下信息的含義，但并不總是可讀的，或者在基于“比較約束和非約束排序”或“測試單個約束軸”模板的分析中顯示的分析筆記本的專用面板中，該字段跳轉到以下字段。
CANOCO 5.12版最新更新
Canoco 5.12 是 Canoco 5.11 的小更新。Canoco 5.12 主要修復了一些錯誤。它還在物種指標值的計算中增加了對顯著性水平的估計。閱讀詳情。
現有 Canoco 5 用戶可以通過幫助|檢查更新進行更新。對于新訂單，請查看更新和訂單。
CANOCO 5.11版最新更新
發表于 2018 年 10 月 29 日
Canoco 5.11 是 Canoco 5.10 的更新，也稱為 Canoco 5.1。此更新增加了響應變量（例如物種）對軸和貢獻雙圖的 Canoco 貢獻。它還擴展了雙標圖和三標圖的“描述內容”，以幫助對其進行解釋和許多其他小的改進。
貢獻雙圖 (Greenacre 2013a,b) 解決了稀有物種看似重要的問題，因為它們通常出現在排序圖的邊緣，但實際上根本不重要。貢獻補充了 Canoco 中的擬合統計數據。
較小的改進包括雙約束排序和共同對應分析中的擬合統計數據，以及對自 Canoco 5 手冊以來最重要更改的方便概述（請參閱詳細信息）。
參考
Greenacre, MJ 2013a。稀有物品在對應分析中的貢獻。生態學 94：241-249。http://dx.doi.org/10.1890/11-1730.1
格林納克，M. 2013b。貢獻雙圖。計算和圖形統計雜志 22：107-122。http://dx.doi.org/10.1080/10618600.2012.702494
CANOCO 5.1版最新更新
Canoco 5.1 實現了用于特征環境分析和微生物組數據分析的新方法。現有的 Canoco 5 客戶可以使用 Canoco 5 中的常規更新過程更新到 Canoco 5.1。
為微生物組分析設計的新方法是加權對數比 PCA（Greenacre 和 Lewi，2009 年），以及類似的 RDA。新版本中包含了 Canoco 用于微生物組分析的可能性的完整示例。
特征環境分析用于通過社區加權平均值 (CWM) 相關性或第四角相關性進行。這些方法將單個特征與單個環境變量相關聯。這些分析現在已完全擴展到多特征多環境變量的情況。新方法允許您檢測哪些特征與環境的相關性最高，反之，哪些環境變量與特征的相關性最高。該方法建立了一個回歸模型，允許您量化性狀、環境和它們的組合解釋了多少變異。
新的性狀環境方法的基本原理已在一份演示文稿和兩篇已發表的論文中進行了總結。第一篇論文鏈接了基于 GLM 的第四角回歸，并擴展了多特征多環境變量案例，即簡單雙約束對應分析 (dc-CA)。第二篇論文全面描述了 dc-CA 和 Canoco 使用的算法。
Cormont 等人的線性特征環境模型。（2011 年）已擴展到類似于雙約束主成分分析（dc-PCA）。
新版本有一個修改后的手冊，每個新許可證都附帶。免費更新隨附 Canoco5/pdf 文件夾中的 pdf，其中包含 Canoco 5.1 中的主要更改（請參閱詳細信息）。
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400-621-1085
